西方生物醫(yī)學理論是建立在近代經典物理學基礎之上，研究對象屬組織解剖學視野所見之實體本體，其認識論基于牛頓機械還原論，研究方法自然側重于線性分解剖析、重復性實驗和數(shù)理統(tǒng)計。在這樣一套科學哲理指導下產生的應用基礎理論，必然形成以清除組織病灶、抑制體內致病菌毒為基本特征的對抗性臨床醫(yī)學技術。
20世紀30年代后，磺胺藥及抗菌素的發(fā)明使細菌性感染得到大幅度地控制，從普外、胸外、腦外再到斷肢再植、器官移植、試管嬰兒培育以至基因重組、克隆技術……無不閃爍著科學理性的光輝，不愧為20世紀造福人類的主流醫(yī)學。
但是，人畢竟不僅僅是一部可拆可卸可安裝可還原的機器，人至少應具備五種不同的屬性：1、自然屬性的人，2、社會屬性的人，3、精神心理屬性的人，4、證候信息屬性的人，5、組織結構(包括器官、細胞、分子)屬性的人。單純針對人的組織結構屬性進行研究，實施防病治病之術，并不足以使生命最大限度地保持健康狀態(tài)，這一見解已逐漸為現(xiàn)代人類所共識(參見聯(lián)合國世界衛(wèi)生組織公布的健康定義)。
中國的醫(yī)學理論，自《黃帝內經》問世，已有2500年的歷史，它的生命觀是建立在中國古代哲學理論"氣一元論"的基礎之上的，中醫(yī)從一開始就把人視為天、地、生大環(huán)境中的一個子系統(tǒng)，研究的本體是陰陽二氣(陽氣與陰血)，繼而引伸出氣行經、血主絡的經絡系統(tǒng)與五臟六腑相生相克的有機協(xié)同，構成了一套自治的整體醫(yī)學理論－陰陽五行、經絡藏象學說，它獨尊天人相應、心身協(xié)同，融自然、生物、社會、心理、信息、證候為一體，強調局部與整體的統(tǒng)一協(xié)調，應用四診合參配合內視法進行人體氣血信息的綜合演繹，實施辨證論治，創(chuàng)建了一套以中草藥、針砭、按摩、導引為主要手段的綜合自然療法。應該承認正是這一中國的傳統(tǒng)醫(yī)學維系著中華民族上下五千年的健康繁衍，華夏大地上才有了擁有數(shù)億人口的泱泱大國。
同時，我們也應該清醒地認識到：正是由于中醫(yī)重視人的無形的關系本體，而相對輕視了實體本體的研究，故而不可能再建立另一套分析、實驗的研究方法。也正是由于中醫(yī)一開始就視人為天人合一的復雜系統(tǒng)，很難將人作為簡單、線性系統(tǒng)進行分解剖析，故而沒有走西方對抗醫(yī)學之路，去著力發(fā)展外科手術，合成藥物療法。在近代西藥學的競爭中，中醫(yī)長期處于受排擠、歧視和被改造的地位，中西醫(yī)學理論上的差異便是20世紀以來中國醫(yī)學百年衰落的根本原因。
但是，隨著現(xiàn)代科學技術的迅猛發(fā)展，伴隨人類社會物質、精神生活水平的提高和自然生態(tài)環(huán)境的惡化，人的疾病譜已發(fā)生了結構性變異，現(xiàn)代綜合征、癌癥、心身疾病、醫(yī)源性疾患等的困擾使人類痛感現(xiàn)代醫(yī)學的局限性，強烈呼吁："回歸自然"。2500年以來發(fā)展起來的中國生命醫(yī)學的整體醫(yī)學思想恰恰可以從理論到技術上補充現(xiàn)代生物醫(yī)學的缺陷和不足，拯救現(xiàn)代醫(yī)學危機。這一歷史契機預示著21世紀中醫(yī)復興的曙光。
如前所述，中西醫(yī)學的研究對象、認識方法迥異，中國生命醫(yī)學與現(xiàn)代生物醫(yī)學的結合，決不能視為技術上的簡單疊加，更不是知識兼并，近50年來我國"中西醫(yī)結合"的歷史已證實了這一論點，真正中西醫(yī)學理論層面上的結合不但有待于現(xiàn)代基礎科學前沿的發(fā)展，更有賴對科學哲學的再認識：認識到人類科學體系發(fā)展的多元性結構，承認至少它有東西方的兩個源、兩個流，摒棄以西方現(xiàn)代分析科學的認識論方法論作為評估科學發(fā)展取向的唯一標準。唯其如此，東西方科學文化才能在相互理解、相互尊重的前提下成功地構筑互相結合的"融通走廊"，建立公平、兼容的科學評價體系，才有可能熔東西方醫(yī)學為一爐，在新千年中，創(chuàng)建人類統(tǒng)一的新醫(yī)學。